子孙殿位于龙王宫正殿东侧，这是古时候求子求孙的地方。其正门即天后宫一进院落西北耳门，门上有匾。殿内东、北、西皆有高台，北高台上设联体神龛3个，中龛有送子娘娘坐像，东西龛分别祀眼光娘娘和疹子娘娘坐像。眼光娘娘保佑儿童心明眼亮，志向远大。疹子娘娘保佑儿童顺利通过疹子关（旧时儿童麻疹死亡率极高，疹子娘娘应运而生，专事保佑儿童出麻疹）。殿内备有蒲团、香炉，殿前正门内南侧壁上设有“宝库”，子孙殿香火历来繁盛。