石垣岛位于北纬24度，在冲绳南部地区，是观星的理想场所。石垣岛天文台由国立天文台、石垣市、石垣教委会、NPO法人八重山星会、冲绳县立石垣青少年之家和琉球大学的6位学者共同运营。馆内有九州和冲绳较大的105厘米口径的光学&红外线反射式望远镜，经常用来观测研究太阳系天体和突发天体，同时也会举办天体观望会向公众普及天体知识。